ЛАБОРАТОРИЯ БИОФОТОНИКИ

Лаборатория биофотоники была создана в 2023 и сконцентрирована на создании и внедрении инноваций в медицине, особенно в области акушерства, гинекологии и перинатологии. Работу проводят специалисты разных направлений, включая биологию, физику, химию и математику, и эта совместная работа дает возможность создавать новые технологические решения и технологии для медицинской практики. Основной целью лаборатории является создание новых методов и приборов для оценки здоровья пациента, диагностики заболеваний на ранних стадиях, терапии и мониторинга эффективности лечения.

Лаборатория сотрудничает со многими институтами России, включая Сколковский Институт Науки и Технологий, Московский Физико-Техническим Институт и др. Международное сотрудничество включает в себя Броуд Массачусетского технологического института и Гарварда, Университет Юты и др.

Сотрудники

Чернышёв Василий Сергеевич  доктор философии в химической инженерии (эквивалентен  кандидату технических наук); руководитель лаборатории Биофотоника

v_chernyshev@oparina4.ru

Колесов Дмитрий Валерьевич - кандидат физико-математических наук; старший научный сотрудник

Александров Артём Игоревич - бакалавр физики, химии и механики материалов; техник

Основные направления исследований

• Поиск маркеров заболеваний (белок, микроРНК и др.)
• Разработка биосенсоров, с использованием сочетания микрофлюидики и оптики
• Разработка высокопроизводительного программного обеспечения для обработки биологических изображений, морфологического профилирования и анализа больших данных
• Разработка и тестирование новых приборов для автоматизации рутинных лабораторных работ в медицине

Лучшие результаты (достижения)

Финал «Falling Walls Venture», Берлин, Германия, 2019

Международное общество чести «Золотой ключ», 2015

Избранные публикации последних лет

2023

1. Kuzin A., Chernyshev V., Kovalyuk V., An P., Golikov A., Goltsman G., Gorin D. Ultrasensitive nanophotonic random spectrometer with microfluidic channels as a sensor for biological applications. Nanomaterials. – 2023. – Т. 13. – №. 1. – С. 81 –14521. ИФ 5,719, Q1

2022

2. Kuzin A., Chernyshev V., Kovalyuk V., An P., Golikov A., Goltsman G., Gorin D. In Situ Monitoring of Layer-by-Layer Assembly Surface Modification of Nanophotonic-Microfluidic Sensor. Analytical Chemistry. – 2022. – Т. 94. – №. 42. – С. 14517–14521. ИФ 8,01, Q1, *Nature Index
3. Chernyshev V., Nozdriukhin D., Chuprov-Netochin R., Tsydenzhapova E., Novoselova M., Gorin D., Yashchenok A. Engineered multicompartment vesicosomes for selective uptake by living cells. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces. – 2022. – Т. 220 – С. 112953. ИФ 5,999, Q1
4. Chernyshev V.S., Skliar M. Quantification of desiccated extracellular vesicles by quartz crystal microbalance. Biosensors (Basel) – 2022. – Т. 12. – №. 6. – С. 371. ИФ 5,74, Q1

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35735519/

5. Chernyshev V.S., Chuprov-Netochin R.N., Tsydenzhapova E., Van Devener B., Leonov S., Gorin D., Skliar M. Dynamic surface tension probe for measuring the concentration of extracellular vesicles. Biochem Biophys Res Commun – 2022. – Т. 609. – С. 189 –194. ИФ 3,575, Q1
6. Yashchenok A.M., Chernyshev V.S., Konovalova E.V., Kholodenko R., Tsydenzhapova E., Shipunova V.O., Schulga A.A., Deyev S.M. and Gorin D.A., AntiCD63Oligonucleotide Functionalized Magnetic Beads for the Rapid Isolation of Small Extracellular Vesicles and Detection of EpCAM and HER2 Membrane Receptors using DARPin Probes. Anal. Sens. – 2022 – Т. 3. – №. 1. – С. e202200059.
7. Chernyshev V.S., Chuprov-Netochin R.N., Tsydenzhapova E., Svirshchevskaya E.V., Poltavtseva R.A., Merdalimova A., Yashchenok A., Keshelava A., Sorokin K., Keshelava V., Sukhikh G.T., Gorin D., Leonov S., Skliar S. Asymmetric depth-filtration: A versatile and scalable method for high-yield isolation of extracellular vesicles with low contamination. Journal of Extracellular Vesicles – 2022. – Т. 11. – №. 8. – С. e12256. ИФ 21,224, Q1
8. Barmin R.A.; Rudakovskaya, P.G.; Chernyshev, V.S.; Guslyakova, O.I.; Sindeeva, O.A.; Prikhozhdenko, E.S.; Bratashov, D.N.; Abdurashitov, A.S.; Maksimova, E.A.; Demina, P.A.; Khaydukov, E.V.; Gayer, A.V.; Shirshin, E.A.; Solovev, A.A.; Mei, Y.; Gorin, D.A. Impact of fluorescent dyes on the physicochemical parameters of microbubbles stabilized by albumin-dye complex. Colloids Surf., A – 2022. – Т. 647. – №. 20. – С. 129095. ИФ 5,518, Q2
9. Kuzin A., Chernyshev V., Kovalyuk V., An P., Golikov A., Ozhegov R., Gorin D., Gippius N.,  Goltsman G. Hybrid nanophotonic–microfluidic sensor for highly sensitive liquid and gas analyses. Opt. Lett. – 2022. – Т. 47. – №. 9. – С. 2358 – 2361. ИФ 3,83, Q1
10. Novoselova, M., Chernyshev, V.S., Schulga, A., Konovalova E.V., Chuprov-Netochin R.N., Abakumova T.O., German S., Shipunova V.O., Mokrousov M.D., Prikhozhdenko  E., Bratashov D.N., Nozdriukhin D.V., Bogorodskiy A., Grishin O., Kosolobov S.S., Khlebtsov B.N., Inozemtseva O., Zatsepin T.S., Deyev, S.M., Gorin, D.A. Effect of Surface Modification of Multifunctional Nanocomposite Drug Delivery Carriers with DARPin on Their Biodistribution In Vitro and In Vivo. ACS Applied Bio Materials  – 2022. – Т. 5. – №. 6. – С. 2976 – 2989. ИФ 3,95, Q1

2021

11. Novoselova M.V., German S.V., Abakumova T.O., Perevoschikov S.V., Sergeeva O.V., Nesterchuk M.V., Efimova O.I., Petrov K.S., Chernyshev V.S., Zatsepin T.S., Gorin D.A. Multifunctional nanostructured drug delivery carriers for cancer therapy: Multimodal imaging and ultrasound-induced drug release. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces – 2021. – Т. 200. – С. 111576. ИФ 5,999, Q1
12. Barmin R.A., Rudakovskaya P.G., Chernyshev V.S., Guslyakova O.I., Belcov P.A., Obukhova E.N., Gayer A.V., Shirshin E.A., Gorin D.A. Optoacoustic/Fluorescent/Acoustic Imaging Probe Based on Air-Filled Bubbles Functionalized with Gold Nanorods and Fluorescein Isothiocyanate. ACS Omega – 2021. – Т. 6. – №. 5. – С. 3809 – 3821. ИФ 4,132, Q1
13. Barmin R.A., Rudakovskaya P.G., Gusliakova O.I., Sindeeva O.A., Prikhozhdenko E.S., Maksimova E.A., Obukhova E.N., Chernyshev V.S., Khlebtsov B.N., Solovev A.A., Sukhorukov G.B., Gorin D.A. Air-filled bubbles stabilized by gold nanoparticle/photodynamic dye hybrid structures for theranostics. Nanomaterials – 2021. – Т. 11. – №. 2. – С. 415. ИФ 5,719, Q1

2019

14. Nozdriukhin D., Besedina N., Chernyshev V., Efimova O., Rudakovskaya P., Novoselova M., Bratashov D., Chuprov-Netochin R., Kamyshinsky R., Vasiliev A., Chermoshentsev D., Dyakov S.A., Zharov V., Gippius N., Gorin D.A., Yashchenok A. Gold nanoparticle-carbon nanotube multilayers on silica microspheres: Optoacoustic-Raman enhancement and potential biomedical applications. Materials Science and Engineering C – 2019. – Т. 120. – С. 111736. ИФ 7,328, Q1
15. Merdalimova A., Chernyshev V., Nozdriukhin D., Rudakovskaya P., Gorin D., Yashchenok A. Identification and analysis of exosomes by surface-enhanced Raman spectroscopy. Appl. Sci. – 2019. – Т. 9. – №. 6. – С. 1135. ИФ 2,838, Q2
16. Skliar M., Chernyshev V.S. Imaging of extracellular vesicles by atomic force microscopy. J Vis Exp. – 2019. – Т. 151. ИФ 1,4, Q2

2018

17. McQuin C., Goodman A., Chernyshev V., Kamentsky L., Karhohs K.W., Cimini B., Doan M., Ding L., Rafelski S.M., Thirstrup D., Wiegraebe W., Carpenter A.E. CellProfiler 3.0: next generation image processing for biology. PLOS Biol. – 2018. – Т. 16. – №. 7. – С. e2005970. ИФ 9,593, Q1, *Nature Index
18. Skliar M., Chernyshev V., Belnap D., Sergey G.; Hakami S., Bernard P.; Stijleman I.; Rachamadugu R. Membrane proteins significantly restrict exosome mobility. Biochem Biophys Res Commun. – 2018. – Т. 501. – №. 4. – С. 1055 – 1059. ИФ 3,575, Q1

2015

19. Jia Y., Chernyshev V.S., Skliar, M. Ultrasound measurements of segmental temperature distribution in solids: method and its high-temperature validation. Ultrasonics. – 2015. – Т. 66. –С. 91 – 102. ИФ 2,89, Q1
20. Chernyshev V.S., Skliar M. Diffusivity measurements of solutes impacting interfacial tension. Ind. Eng. Chem. Res. – 2015. – Т. 54. – №. 16. – С. 4535 – 4544. ИФ 3,72, Q1
21. Chernyshev V.S., Rachamadugu R., Tseng Y.H., Belnap D., Jia Y., Branch K., Butterfield A., Pease L., Bernard P., Skliar M. Size and shape characterization of hydrated and desiccated exosomes. Anal. Bioanal. Chem. – 2015. – Т. 407. – С. 3285 – 3301. ИФ 4,48, Q1

2014

22. Chernyshev V.S., Skliar M. Surface tension of water in the presence of perfluorocarbon vapor. Soft Matter – 2014. – Т. 10. – №. 12. – С. 1937 – 1943. ИФ 4,05, Q1

2009

23. Wyatt H.R., Ogden L.G., Cassic K.S., Hoagland E.A., McKinnon T., Eich N., Chernyshev V.S., Wood T., Cuomo J., Hill J.O. Successful internet-based lifestyle change program on body weight and markers of metabolic health. Obes.Weight Manag. – 2009. – Т. 5. – №. 4. – С. 167 – 173